Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SHEQ5VZ18 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SHEQ5VZ18 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms