Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTH9

WDR78, WD repeat-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR78Q5VTH9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
WDR78Q5VTH9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
WDR78Q5VTH9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
WDR78Q5VTH9 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
WDR78Q5VTH9 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
WDR78Q5VTH9 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
WDR78Q5VTH9 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
WDR78Q5VTH9 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
WDR78Q5VTH9 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
WDR78Q5VTH9 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
WDR78Q5VTH9 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
WDR78Q5VTH9 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
WDR78Q5VTH9 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
WDR78Q5VTH9 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
WDR78Q5VTH9 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
WDR78Q5VTH9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
WDR78Q5VTH9 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
WDR78Q5VTH9 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
WDR78Q5VTH9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
WDR78Q5VTH9 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
WDR78Q5VTH9 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
WDR78Q5VTH9 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
WDR78Q5VTH9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
WDR78Q5VTH9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
WDR78Q5VTH9 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
WDR78Q5VTH9 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
WDR78Q5VTH9 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
WDR78Q5VTH9 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
WDR78Q5VTH9 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
WDR78Q5VTH9 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
WDR78Q5VTH9 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
WDR78Q5VTH9 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
WDR78Q5VTH9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
WDR78Q5VTH9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
WDR78Q5VTH9 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
WDR78Q5VTH9 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
WDR78Q5VTH9 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
WDR78Q5VTH9 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
WDR78Q5VTH9 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
WDR78Q5VTH9 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
WDR78Q5VTH9 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
WDR78Q5VTH9 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
WDR78Q5VTH9 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
WDR78Q5VTH9 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
WDR78Q5VTH9 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
WDR78Q5VTH9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
WDR78Q5VTH9 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms