Protein–RNA interactions for Protein: Q56NI9

ESCO2, N-acetyltransferase ESCO2, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESCO2Q56NI9 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ESCO2Q56NI9 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ESCO2Q56NI9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ESCO2Q56NI9 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ESCO2Q56NI9 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ESCO2Q56NI9 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ESCO2Q56NI9 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ESCO2Q56NI9 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ESCO2Q56NI9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ESCO2Q56NI9 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ESCO2Q56NI9 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ESCO2Q56NI9 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ESCO2Q56NI9 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ESCO2Q56NI9 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ESCO2Q56NI9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ESCO2Q56NI9 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ESCO2Q56NI9 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ESCO2Q56NI9 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ESCO2Q56NI9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ESCO2Q56NI9 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ESCO2Q56NI9 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ESCO2Q56NI9 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ESCO2Q56NI9 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ESCO2Q56NI9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ESCO2Q56NI9 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ESCO2Q56NI9 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ESCO2Q56NI9 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ESCO2Q56NI9 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ESCO2Q56NI9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ESCO2Q56NI9 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ESCO2Q56NI9 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ESCO2Q56NI9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ESCO2Q56NI9 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ESCO2Q56NI9 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ESCO2Q56NI9 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ESCO2Q56NI9 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ESCO2Q56NI9 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ESCO2Q56NI9 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ESCO2Q56NI9 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ESCO2Q56NI9 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ESCO2Q56NI9 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ESCO2Q56NI9 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ESCO2Q56NI9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ESCO2Q56NI9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ESCO2Q56NI9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ESCO2Q56NI9 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ESCO2Q56NI9 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ESCO2Q56NI9 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ESCO2Q56NI9 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ESCO2Q56NI9 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ESCO2Q56NI9 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ESCO2Q56NI9 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ESCO2Q56NI9 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ESCO2Q56NI9 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ESCO2Q56NI9 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ESCO2Q56NI9 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ESCO2Q56NI9 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ESCO2Q56NI9 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ESCO2Q56NI9 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ESCO2Q56NI9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ESCO2Q56NI9 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ESCO2Q56NI9 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ESCO2Q56NI9 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ESCO2Q56NI9 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ESCO2Q56NI9 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ESCO2Q56NI9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ESCO2Q56NI9 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ESCO2Q56NI9 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ESCO2Q56NI9 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ESCO2Q56NI9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ESCO2Q56NI9 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ESCO2Q56NI9 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ESCO2Q56NI9 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ESCO2Q56NI9 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ESCO2Q56NI9 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ESCO2Q56NI9 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ESCO2Q56NI9 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ESCO2Q56NI9 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ESCO2Q56NI9 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ESCO2Q56NI9 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ESCO2Q56NI9 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ESCO2Q56NI9 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ESCO2Q56NI9 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ESCO2Q56NI9 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ESCO2Q56NI9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ESCO2Q56NI9 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ESCO2Q56NI9 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ESCO2Q56NI9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ESCO2Q56NI9 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ESCO2Q56NI9 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ESCO2Q56NI9 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ESCO2Q56NI9 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ESCO2Q56NI9 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ESCO2Q56NI9 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ESCO2Q56NI9 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ESCO2Q56NI9 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ESCO2Q56NI9 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ESCO2Q56NI9 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ESCO2Q56NI9 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ESCO2Q56NI9 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms