Protein–RNA interactions for Protein: Q29983

MICA, MHC class I polypeptide-related sequence A, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAQ29983 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MICAQ29983 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MICAQ29983 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MICAQ29983 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MICAQ29983 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MICAQ29983 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MICAQ29983 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
MICAQ29983 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MICAQ29983 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MICAQ29983 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MICAQ29983 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
MICAQ29983 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MICAQ29983 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MICAQ29983 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MICAQ29983 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MICAQ29983 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MICAQ29983 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MICAQ29983 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MICAQ29983 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MICAQ29983 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MICAQ29983 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MICAQ29983 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MICAQ29983 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MICAQ29983 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MICAQ29983 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MICAQ29983 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MICAQ29983 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MICAQ29983 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MICAQ29983 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MICAQ29983 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MICAQ29983 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MICAQ29983 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MICAQ29983 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
MICAQ29983 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MICAQ29983 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
MICAQ29983 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MICAQ29983 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MICAQ29983 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MICAQ29983 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MICAQ29983 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MICAQ29983 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MICAQ29983 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MICAQ29983 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MICAQ29983 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MICAQ29983 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MICAQ29983 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MICAQ29983 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MICAQ29983 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MICAQ29983 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
MICAQ29983 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MICAQ29983 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MICAQ29983 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MICAQ29983 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MICAQ29983 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MICAQ29983 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MICAQ29983 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MICAQ29983 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MICAQ29983 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MICAQ29983 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MICAQ29983 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MICAQ29983 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MICAQ29983 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
MICAQ29983 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MICAQ29983 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MICAQ29983 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MICAQ29983 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MICAQ29983 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MICAQ29983 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
MICAQ29983 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MICAQ29983 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MICAQ29983 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MICAQ29983 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MICAQ29983 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MICAQ29983 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MICAQ29983 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MICAQ29983 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MICAQ29983 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MICAQ29983 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MICAQ29983 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MICAQ29983 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MICAQ29983 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MICAQ29983 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MICAQ29983 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MICAQ29983 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MICAQ29983 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MICAQ29983 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MICAQ29983 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MICAQ29983 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MICAQ29983 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MICAQ29983 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MICAQ29983 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MICAQ29983 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MICAQ29983 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MICAQ29983 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MICAQ29983 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MICAQ29983 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MICAQ29983 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MICAQ29983 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MICAQ29983 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MICAQ29983 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms