Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RTL8BQ17RB0 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RTL8BQ17RB0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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