Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PCSK7Q16549 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
PCSK7Q16549 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PCSK7Q16549 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PCSK7Q16549 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PCSK7Q16549 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PCSK7Q16549 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PCSK7Q16549 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PCSK7Q16549 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PCSK7Q16549 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PCSK7Q16549 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PCSK7Q16549 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PCSK7Q16549 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PCSK7Q16549 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PCSK7Q16549 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PCSK7Q16549 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PCSK7Q16549 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PCSK7Q16549 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PCSK7Q16549 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PCSK7Q16549 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PCSK7Q16549 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PCSK7Q16549 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PCSK7Q16549 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PCSK7Q16549 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PCSK7Q16549 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PCSK7Q16549 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PCSK7Q16549 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PCSK7Q16549 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PCSK7Q16549 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PCSK7Q16549 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PCSK7Q16549 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PCSK7Q16549 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PCSK7Q16549 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PCSK7Q16549 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PCSK7Q16549 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PCSK7Q16549 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PCSK7Q16549 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PCSK7Q16549 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PCSK7Q16549 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PCSK7Q16549 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PCSK7Q16549 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms