Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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PDE6HQ13956 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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PDE6HQ13956 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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PDE6HQ13956 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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PDE6HQ13956 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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PDE6HQ13956 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PDE6HQ13956 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDE6HQ13956 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDE6HQ13956 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDE6HQ13956 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDE6HQ13956 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDE6HQ13956 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDE6HQ13956 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDE6HQ13956 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDE6HQ13956 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDE6HQ13956 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDE6HQ13956 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDE6HQ13956 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDE6HQ13956 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDE6HQ13956 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDE6HQ13956 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDE6HQ13956 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDE6HQ13956 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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