Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CUL4AQ13619 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CUL4AQ13619 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CUL4AQ13619 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CUL4AQ13619 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CUL4AQ13619 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CUL4AQ13619 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CUL4AQ13619 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CUL4AQ13619 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CUL4AQ13619 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CUL4AQ13619 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CUL4AQ13619 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CUL4AQ13619 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CUL4AQ13619 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CUL4AQ13619 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CUL4AQ13619 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CUL4AQ13619 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CUL4AQ13619 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CUL4AQ13619 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CUL4AQ13619 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CUL4AQ13619 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CUL4AQ13619 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CUL4AQ13619 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CUL4AQ13619 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CUL4AQ13619 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CUL4AQ13619 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CUL4AQ13619 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CUL4AQ13619 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CUL4AQ13619 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CUL4AQ13619 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CUL4AQ13619 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CUL4AQ13619 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CUL4AQ13619 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CUL4AQ13619 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CUL4AQ13619 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CUL4AQ13619 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CUL4AQ13619 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CUL4AQ13619 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CUL4AQ13619 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CUL4AQ13619 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CUL4AQ13619 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CUL4AQ13619 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CUL4AQ13619 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CUL4AQ13619 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CUL4AQ13619 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CUL4AQ13619 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CUL4AQ13619 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CUL4AQ13619 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
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