Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATMQ13315 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATMQ13315 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATMQ13315 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATMQ13315 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATMQ13315 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATMQ13315 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATMQ13315 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATMQ13315 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATMQ13315 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATMQ13315 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATMQ13315 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATMQ13315 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
ATMQ13315 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATMQ13315 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATMQ13315 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
ATMQ13315 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATMQ13315 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATMQ13315 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATMQ13315 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATMQ13315 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ATMQ13315 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATMQ13315 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATMQ13315 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATMQ13315 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATMQ13315 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATMQ13315 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATMQ13315 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ATMQ13315 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATMQ13315 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATMQ13315 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATMQ13315 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATMQ13315 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATMQ13315 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATMQ13315 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATMQ13315 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATMQ13315 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATMQ13315 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATMQ13315 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ATMQ13315 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATMQ13315 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATMQ13315 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATMQ13315 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATMQ13315 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATMQ13315 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATMQ13315 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATMQ13315 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATMQ13315 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATMQ13315 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATMQ13315 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATMQ13315 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATMQ13315 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATMQ13315 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATMQ13315 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATMQ13315 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATMQ13315 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATMQ13315 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATMQ13315 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATMQ13315 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATMQ13315 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATMQ13315 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATMQ13315 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATMQ13315 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATMQ13315 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATMQ13315 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATMQ13315 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATMQ13315 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATMQ13315 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATMQ13315 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATMQ13315 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATMQ13315 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATMQ13315 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATMQ13315 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATMQ13315 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATMQ13315 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATMQ13315 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATMQ13315 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATMQ13315 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATMQ13315 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATMQ13315 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ATMQ13315 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATMQ13315 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATMQ13315 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATMQ13315 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATMQ13315 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ATMQ13315 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATMQ13315 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATMQ13315 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATMQ13315 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATMQ13315 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATMQ13315 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATMQ13315 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATMQ13315 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ATMQ13315 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATMQ13315 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATMQ13315 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATMQ13315 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATMQ13315 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATMQ13315 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATMQ13315 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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