Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SRSF6Q13247 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SRSF6Q13247 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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