Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIK2Q13002 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
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