Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CNTN1Q12860 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNTN1Q12860 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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