Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
TROQ12816 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
TROQ12816 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
TROQ12816 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
TROQ12816 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
TROQ12816 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
TROQ12816 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
TROQ12816 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
TROQ12816 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
TROQ12816 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
TROQ12816 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
TROQ12816 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC31.22■■■□□ 2.59
TROQ12816 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
TROQ12816 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
TROQ12816 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
TROQ12816 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
TROQ12816 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
TROQ12816 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
TROQ12816 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
TROQ12816 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
TROQ12816 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
TROQ12816 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC31.22■■■□□ 2.59
TROQ12816 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
TROQ12816 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
TROQ12816 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
TROQ12816 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
TROQ12816 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
TROQ12816 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
TROQ12816 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
TROQ12816 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
TROQ12816 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
TROQ12816 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
TROQ12816 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
TROQ12816 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
TROQ12816 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
TROQ12816 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
TROQ12816 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
TROQ12816 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
TROQ12816 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
TROQ12816 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
TROQ12816 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
TROQ12816 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
TROQ12816 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
TROQ12816 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
TROQ12816 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
TROQ12816 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
TROQ12816 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
TROQ12816 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
TROQ12816 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC31.19■■■□□ 2.58
TROQ12816 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
TROQ12816 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
TROQ12816 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
TROQ12816 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
TROQ12816 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
TROQ12816 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
TROQ12816 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
TROQ12816 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
TROQ12816 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC31.18■■■□□ 2.58
TROQ12816 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
TROQ12816 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
TROQ12816 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
TROQ12816 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
TROQ12816 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
TROQ12816 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC31.17■■■□□ 2.58
TROQ12816 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
TROQ12816 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
TROQ12816 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
TROQ12816 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
TROQ12816 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
TROQ12816 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
TROQ12816 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
TROQ12816 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
TROQ12816 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
TROQ12816 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
TROQ12816 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC31.16■■■□□ 2.58
TROQ12816 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
TROQ12816 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
TROQ12816 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
TROQ12816 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
TROQ12816 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
TROQ12816 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
TROQ12816 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
TROQ12816 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC31.15■■■□□ 2.58
TROQ12816 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
TROQ12816 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
TROQ12816 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
TROQ12816 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
TROQ12816 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
TROQ12816 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
TROQ12816 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
TROQ12816 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
TROQ12816 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
TROQ12816 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
TROQ12816 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
TROQ12816 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
TROQ12816 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
TROQ12816 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
TROQ12816 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.57
TROQ12816 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
TROQ12816 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.57
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