Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNMA1Q12791 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
KCNMA1Q12791 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
KCNMA1Q12791 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
KCNMA1Q12791 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNMA1Q12791 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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