Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CPSF1Q10570 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CPSF1Q10570 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CPSF1Q10570 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CPSF1Q10570 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CPSF1Q10570 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CPSF1Q10570 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CPSF1Q10570 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CPSF1Q10570 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CPSF1Q10570 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CPSF1Q10570 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CPSF1Q10570 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CPSF1Q10570 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CPSF1Q10570 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CPSF1Q10570 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CPSF1Q10570 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CPSF1Q10570 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CPSF1Q10570 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CPSF1Q10570 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CPSF1Q10570 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CPSF1Q10570 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CPSF1Q10570 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CPSF1Q10570 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CPSF1Q10570 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CPSF1Q10570 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CPSF1Q10570 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CPSF1Q10570 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CPSF1Q10570 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CPSF1Q10570 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CPSF1Q10570 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CPSF1Q10570 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CPSF1Q10570 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CPSF1Q10570 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CPSF1Q10570 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CPSF1Q10570 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CPSF1Q10570 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CPSF1Q10570 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CPSF1Q10570 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CPSF1Q10570 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CPSF1Q10570 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CPSF1Q10570 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CPSF1Q10570 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CPSF1Q10570 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CPSF1Q10570 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CPSF1Q10570 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CPSF1Q10570 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CPSF1Q10570 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CPSF1Q10570 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CPSF1Q10570 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
CPSF1Q10570 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
CPSF1Q10570 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
CPSF1Q10570 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC27.58■■■□□ 2
CPSF1Q10570 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
CPSF1Q10570 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CPSF1Q10570 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CPSF1Q10570 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CPSF1Q10570 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CPSF1Q10570 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CPSF1Q10570 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CPSF1Q10570 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CPSF1Q10570 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CPSF1Q10570 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CPSF1Q10570 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CPSF1Q10570 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CPSF1Q10570 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CPSF1Q10570 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CPSF1Q10570 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CPSF1Q10570 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CPSF1Q10570 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CPSF1Q10570 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CPSF1Q10570 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CPSF1Q10570 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CPSF1Q10570 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CPSF1Q10570 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CPSF1Q10570 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CPSF1Q10570 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CPSF1Q10570 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CPSF1Q10570 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CPSF1Q10570 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CPSF1Q10570 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CPSF1Q10570 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CPSF1Q10570 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CPSF1Q10570 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
CPSF1Q10570 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CPSF1Q10570 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CPSF1Q10570 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CPSF1Q10570 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CPSF1Q10570 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CPSF1Q10570 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CPSF1Q10570 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CPSF1Q10570 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CPSF1Q10570 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CPSF1Q10570 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CPSF1Q10570 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CPSF1Q10570 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CPSF1Q10570 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CPSF1Q10570 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CPSF1Q10570 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CPSF1Q10570 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CPSF1Q10570 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
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