Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CD300CQ08708 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD300CQ08708 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms