Protein–RNA interactions for Protein: Q06455

RUNX1T1, Protein CBFA2T1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1T1Q06455 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RUNX1T1Q06455 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RUNX1T1Q06455 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RUNX1T1Q06455 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RUNX1T1Q06455 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RUNX1T1Q06455 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RUNX1T1Q06455 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RUNX1T1Q06455 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RUNX1T1Q06455 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RUNX1T1Q06455 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RUNX1T1Q06455 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RUNX1T1Q06455 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RUNX1T1Q06455 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RUNX1T1Q06455 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RUNX1T1Q06455 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RUNX1T1Q06455 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RUNX1T1Q06455 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RUNX1T1Q06455 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RUNX1T1Q06455 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RUNX1T1Q06455 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RUNX1T1Q06455 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RUNX1T1Q06455 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RUNX1T1Q06455 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RUNX1T1Q06455 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RUNX1T1Q06455 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RUNX1T1Q06455 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RUNX1T1Q06455 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RUNX1T1Q06455 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RUNX1T1Q06455 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RUNX1T1Q06455 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RUNX1T1Q06455 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RUNX1T1Q06455 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RUNX1T1Q06455 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RUNX1T1Q06455 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RUNX1T1Q06455 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RUNX1T1Q06455 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RUNX1T1Q06455 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RUNX1T1Q06455 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RUNX1T1Q06455 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RUNX1T1Q06455 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RUNX1T1Q06455 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RUNX1T1Q06455 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RUNX1T1Q06455 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RUNX1T1Q06455 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RUNX1T1Q06455 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RUNX1T1Q06455 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RUNX1T1Q06455 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RUNX1T1Q06455 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RUNX1T1Q06455 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RUNX1T1Q06455 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RUNX1T1Q06455 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RUNX1T1Q06455 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RUNX1T1Q06455 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RUNX1T1Q06455 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RUNX1T1Q06455 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RUNX1T1Q06455 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RUNX1T1Q06455 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RUNX1T1Q06455 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RUNX1T1Q06455 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RUNX1T1Q06455 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RUNX1T1Q06455 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RUNX1T1Q06455 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RUNX1T1Q06455 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RUNX1T1Q06455 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RUNX1T1Q06455 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RUNX1T1Q06455 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RUNX1T1Q06455 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RUNX1T1Q06455 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RUNX1T1Q06455 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RUNX1T1Q06455 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RUNX1T1Q06455 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RUNX1T1Q06455 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RUNX1T1Q06455 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RUNX1T1Q06455 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RUNX1T1Q06455 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RUNX1T1Q06455 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RUNX1T1Q06455 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RUNX1T1Q06455 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RUNX1T1Q06455 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RUNX1T1Q06455 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RUNX1T1Q06455 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RUNX1T1Q06455 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RUNX1T1Q06455 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RUNX1T1Q06455 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RUNX1T1Q06455 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RUNX1T1Q06455 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RUNX1T1Q06455 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RUNX1T1Q06455 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RUNX1T1Q06455 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RUNX1T1Q06455 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RUNX1T1Q06455 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RUNX1T1Q06455 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RUNX1T1Q06455 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RUNX1T1Q06455 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RUNX1T1Q06455 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RUNX1T1Q06455 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RUNX1T1Q06455 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RUNX1T1Q06455 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RUNX1T1Q06455 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RUNX1T1Q06455 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms