Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
ERCC6Q03468 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
ERCC6Q03468 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
ERCC6Q03468 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
ERCC6Q03468 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
ERCC6Q03468 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC35.01■■■■□ 3.19
ERCC6Q03468 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
ERCC6Q03468 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
ERCC6Q03468 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.19
ERCC6Q03468 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.19
ERCC6Q03468 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
ERCC6Q03468 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
ERCC6Q03468 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC35.01■■■■□ 3.19
ERCC6Q03468 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
ERCC6Q03468 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
ERCC6Q03468 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
ERCC6Q03468 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
ERCC6Q03468 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
ERCC6Q03468 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
ERCC6Q03468 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
ERCC6Q03468 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
ERCC6Q03468 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
ERCC6Q03468 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
ERCC6Q03468 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
ERCC6Q03468 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
ERCC6Q03468 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
ERCC6Q03468 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
ERCC6Q03468 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
ERCC6Q03468 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
ERCC6Q03468 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
ERCC6Q03468 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
ERCC6Q03468 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
ERCC6Q03468 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
ERCC6Q03468 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
ERCC6Q03468 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
ERCC6Q03468 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
ERCC6Q03468 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC34.97■■■■□ 3.19
ERCC6Q03468 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
ERCC6Q03468 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
ERCC6Q03468 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
ERCC6Q03468 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
ERCC6Q03468 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
ERCC6Q03468 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
ERCC6Q03468 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
ERCC6Q03468 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
ERCC6Q03468 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
ERCC6Q03468 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
ERCC6Q03468 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
ERCC6Q03468 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
ERCC6Q03468 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
ERCC6Q03468 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
ERCC6Q03468 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
ERCC6Q03468 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
ERCC6Q03468 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
ERCC6Q03468 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
ERCC6Q03468 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
ERCC6Q03468 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
ERCC6Q03468 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
ERCC6Q03468 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
ERCC6Q03468 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
ERCC6Q03468 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
ERCC6Q03468 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
ERCC6Q03468 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
ERCC6Q03468 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC34.96■■■■□ 3.19
ERCC6Q03468 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
ERCC6Q03468 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC34.96■■■■□ 3.19
ERCC6Q03468 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
ERCC6Q03468 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
ERCC6Q03468 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
ERCC6Q03468 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
ERCC6Q03468 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
ERCC6Q03468 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
ERCC6Q03468 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
ERCC6Q03468 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
ERCC6Q03468 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
ERCC6Q03468 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
ERCC6Q03468 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
ERCC6Q03468 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
ERCC6Q03468 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
ERCC6Q03468 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
ERCC6Q03468 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
ERCC6Q03468 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
ERCC6Q03468 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC34.93■■■■□ 3.18
ERCC6Q03468 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
ERCC6Q03468 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
ERCC6Q03468 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
ERCC6Q03468 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
ERCC6Q03468 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC34.92■■■■□ 3.18
ERCC6Q03468 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
ERCC6Q03468 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
ERCC6Q03468 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
ERCC6Q03468 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
ERCC6Q03468 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
ERCC6Q03468 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
ERCC6Q03468 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
ERCC6Q03468 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
ERCC6Q03468 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
ERCC6Q03468 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
ERCC6Q03468 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
ERCC6Q03468 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms