Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DSC2Q02487 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms