Protein–RNA interactions for Protein: Q00266

MAT1A, S-adenosylmethionine synthase isoform type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAT1AQ00266 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MAT1AQ00266 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MAT1AQ00266 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MAT1AQ00266 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MAT1AQ00266 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MAT1AQ00266 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MAT1AQ00266 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MAT1AQ00266 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MAT1AQ00266 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MAT1AQ00266 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MAT1AQ00266 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MAT1AQ00266 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MAT1AQ00266 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MAT1AQ00266 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
MAT1AQ00266 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MAT1AQ00266 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MAT1AQ00266 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MAT1AQ00266 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MAT1AQ00266 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MAT1AQ00266 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MAT1AQ00266 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MAT1AQ00266 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MAT1AQ00266 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MAT1AQ00266 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MAT1AQ00266 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MAT1AQ00266 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MAT1AQ00266 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MAT1AQ00266 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MAT1AQ00266 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MAT1AQ00266 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MAT1AQ00266 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MAT1AQ00266 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MAT1AQ00266 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MAT1AQ00266 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MAT1AQ00266 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
MAT1AQ00266 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MAT1AQ00266 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MAT1AQ00266 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MAT1AQ00266 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MAT1AQ00266 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MAT1AQ00266 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MAT1AQ00266 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MAT1AQ00266 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MAT1AQ00266 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MAT1AQ00266 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MAT1AQ00266 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MAT1AQ00266 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MAT1AQ00266 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MAT1AQ00266 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MAT1AQ00266 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MAT1AQ00266 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MAT1AQ00266 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MAT1AQ00266 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MAT1AQ00266 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
MAT1AQ00266 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MAT1AQ00266 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MAT1AQ00266 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MAT1AQ00266 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MAT1AQ00266 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MAT1AQ00266 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MAT1AQ00266 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MAT1AQ00266 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MAT1AQ00266 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MAT1AQ00266 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MAT1AQ00266 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MAT1AQ00266 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MAT1AQ00266 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MAT1AQ00266 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MAT1AQ00266 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MAT1AQ00266 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MAT1AQ00266 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MAT1AQ00266 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
MAT1AQ00266 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MAT1AQ00266 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MAT1AQ00266 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
MAT1AQ00266 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MAT1AQ00266 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MAT1AQ00266 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MAT1AQ00266 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MAT1AQ00266 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MAT1AQ00266 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MAT1AQ00266 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MAT1AQ00266 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MAT1AQ00266 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MAT1AQ00266 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MAT1AQ00266 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MAT1AQ00266 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MAT1AQ00266 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MAT1AQ00266 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MAT1AQ00266 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MAT1AQ00266 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MAT1AQ00266 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
MAT1AQ00266 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MAT1AQ00266 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
MAT1AQ00266 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MAT1AQ00266 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MAT1AQ00266 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MAT1AQ00266 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MAT1AQ00266 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MAT1AQ00266 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms