Protein–RNA interactions for Protein: P69849

NOMO3, Nodal modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3P69849 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NOMO3P69849 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NOMO3P69849 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NOMO3P69849 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NOMO3P69849 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NOMO3P69849 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NOMO3P69849 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NOMO3P69849 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NOMO3P69849 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NOMO3P69849 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NOMO3P69849 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NOMO3P69849 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NOMO3P69849 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NOMO3P69849 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NOMO3P69849 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NOMO3P69849 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NOMO3P69849 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NOMO3P69849 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NOMO3P69849 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NOMO3P69849 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NOMO3P69849 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NOMO3P69849 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NOMO3P69849 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NOMO3P69849 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NOMO3P69849 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NOMO3P69849 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NOMO3P69849 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NOMO3P69849 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NOMO3P69849 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NOMO3P69849 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NOMO3P69849 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NOMO3P69849 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NOMO3P69849 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NOMO3P69849 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NOMO3P69849 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NOMO3P69849 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NOMO3P69849 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NOMO3P69849 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NOMO3P69849 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NOMO3P69849 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NOMO3P69849 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NOMO3P69849 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NOMO3P69849 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NOMO3P69849 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NOMO3P69849 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NOMO3P69849 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NOMO3P69849 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NOMO3P69849 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NOMO3P69849 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NOMO3P69849 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NOMO3P69849 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NOMO3P69849 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NOMO3P69849 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOMO3P69849 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOMO3P69849 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOMO3P69849 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOMO3P69849 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOMO3P69849 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOMO3P69849 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOMO3P69849 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOMO3P69849 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOMO3P69849 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOMO3P69849 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOMO3P69849 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOMO3P69849 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOMO3P69849 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOMO3P69849 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOMO3P69849 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOMO3P69849 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NOMO3P69849 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NOMO3P69849 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NOMO3P69849 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NOMO3P69849 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NOMO3P69849 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NOMO3P69849 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NOMO3P69849 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NOMO3P69849 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NOMO3P69849 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NOMO3P69849 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NOMO3P69849 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NOMO3P69849 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NOMO3P69849 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NOMO3P69849 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NOMO3P69849 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NOMO3P69849 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NOMO3P69849 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NOMO3P69849 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NOMO3P69849 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms