Protein–RNA interactions for Protein: P60900

PSMA6, Proteasome subunit alpha type-6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA6P60900 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMA6P60900 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms