Protein–RNA interactions for Protein: P56962

STX17, Syntaxin-17, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX17P56962 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STX17P56962 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STX17P56962 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STX17P56962 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STX17P56962 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STX17P56962 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STX17P56962 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STX17P56962 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STX17P56962 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STX17P56962 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STX17P56962 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STX17P56962 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STX17P56962 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STX17P56962 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STX17P56962 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
STX17P56962 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STX17P56962 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STX17P56962 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STX17P56962 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STX17P56962 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STX17P56962 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STX17P56962 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STX17P56962 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STX17P56962 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STX17P56962 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STX17P56962 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STX17P56962 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STX17P56962 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STX17P56962 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STX17P56962 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STX17P56962 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STX17P56962 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STX17P56962 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STX17P56962 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STX17P56962 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STX17P56962 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STX17P56962 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STX17P56962 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STX17P56962 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STX17P56962 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX17P56962 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX17P56962 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX17P56962 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX17P56962 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX17P56962 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX17P56962 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX17P56962 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX17P56962 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX17P56962 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX17P56962 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX17P56962 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX17P56962 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
STX17P56962 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX17P56962 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
STX17P56962 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX17P56962 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX17P56962 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX17P56962 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
STX17P56962 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX17P56962 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX17P56962 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX17P56962 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX17P56962 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX17P56962 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX17P56962 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
STX17P56962 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX17P56962 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX17P56962 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STX17P56962 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
STX17P56962 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
STX17P56962 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
STX17P56962 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STX17P56962 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STX17P56962 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
STX17P56962 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STX17P56962 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STX17P56962 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STX17P56962 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STX17P56962 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STX17P56962 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STX17P56962 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STX17P56962 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STX17P56962 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STX17P56962 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STX17P56962 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STX17P56962 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STX17P56962 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STX17P56962 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STX17P56962 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STX17P56962 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STX17P56962 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STX17P56962 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STX17P56962 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STX17P56962 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STX17P56962 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STX17P56962 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STX17P56962 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STX17P56962 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STX17P56962 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STX17P56962 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms