Protein–RNA interactions for Protein: P54136

RARS, Arginine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARSP54136 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RARSP54136 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RARSP54136 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
RARSP54136 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RARSP54136 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RARSP54136 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RARSP54136 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
RARSP54136 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RARSP54136 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RARSP54136 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RARSP54136 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RARSP54136 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RARSP54136 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RARSP54136 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RARSP54136 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RARSP54136 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RARSP54136 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RARSP54136 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RARSP54136 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RARSP54136 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RARSP54136 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RARSP54136 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RARSP54136 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RARSP54136 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RARSP54136 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RARSP54136 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
RARSP54136 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RARSP54136 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RARSP54136 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RARSP54136 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RARSP54136 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RARSP54136 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
RARSP54136 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
RARSP54136 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RARSP54136 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RARSP54136 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RARSP54136 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RARSP54136 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RARSP54136 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RARSP54136 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RARSP54136 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RARSP54136 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RARSP54136 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RARSP54136 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RARSP54136 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RARSP54136 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RARSP54136 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RARSP54136 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RARSP54136 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RARSP54136 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RARSP54136 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RARSP54136 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RARSP54136 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RARSP54136 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
RARSP54136 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RARSP54136 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
RARSP54136 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RARSP54136 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RARSP54136 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RARSP54136 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
RARSP54136 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RARSP54136 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RARSP54136 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RARSP54136 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RARSP54136 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RARSP54136 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RARSP54136 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RARSP54136 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RARSP54136 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RARSP54136 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RARSP54136 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RARSP54136 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RARSP54136 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RARSP54136 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RARSP54136 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RARSP54136 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RARSP54136 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RARSP54136 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RARSP54136 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RARSP54136 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RARSP54136 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RARSP54136 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RARSP54136 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RARSP54136 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RARSP54136 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RARSP54136 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RARSP54136 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RARSP54136 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RARSP54136 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RARSP54136 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RARSP54136 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RARSP54136 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RARSP54136 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RARSP54136 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RARSP54136 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
RARSP54136 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RARSP54136 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RARSP54136 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RARSP54136 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
RARSP54136 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms