Protein–RNA interactions for Protein: P54132

BLM, Bloom syndrome protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BLMP54132 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BLMP54132 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BLMP54132 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BLMP54132 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BLMP54132 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BLMP54132 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
BLMP54132 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BLMP54132 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
BLMP54132 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BLMP54132 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
BLMP54132 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
BLMP54132 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
BLMP54132 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
BLMP54132 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
BLMP54132 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
BLMP54132 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BLMP54132 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BLMP54132 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BLMP54132 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BLMP54132 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
BLMP54132 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
BLMP54132 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
BLMP54132 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
BLMP54132 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
BLMP54132 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BLMP54132 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BLMP54132 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
BLMP54132 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
BLMP54132 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
BLMP54132 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
BLMP54132 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
BLMP54132 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
BLMP54132 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
BLMP54132 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
BLMP54132 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
BLMP54132 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
BLMP54132 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
BLMP54132 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
BLMP54132 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
BLMP54132 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
BLMP54132 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
BLMP54132 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
BLMP54132 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
BLMP54132 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BLMP54132 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BLMP54132 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BLMP54132 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
BLMP54132 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BLMP54132 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
BLMP54132 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
BLMP54132 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
BLMP54132 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
BLMP54132 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BLMP54132 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BLMP54132 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
BLMP54132 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
BLMP54132 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
BLMP54132 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
BLMP54132 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
BLMP54132 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.03
BLMP54132 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
BLMP54132 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
BLMP54132 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
BLMP54132 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
BLMP54132 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
BLMP54132 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
BLMP54132 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
BLMP54132 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
BLMP54132 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BLMP54132 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BLMP54132 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BLMP54132 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BLMP54132 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BLMP54132 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BLMP54132 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BLMP54132 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BLMP54132 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BLMP54132 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
BLMP54132 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BLMP54132 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BLMP54132 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BLMP54132 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BLMP54132 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BLMP54132 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BLMP54132 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BLMP54132 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BLMP54132 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BLMP54132 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BLMP54132 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BLMP54132 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BLMP54132 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BLMP54132 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BLMP54132 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BLMP54132 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
BLMP54132 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BLMP54132 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
BLMP54132 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
BLMP54132 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BLMP54132 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BLMP54132 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms