Protein–RNA interactions for Protein: P53011

SEH1, Nucleoporin SEH1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEH1P53011 RBK1YCR036W 1002 nt1.6□□□□□ -2.15
SEH1P53011 CBS1YDL069C 690 nt1.6□□□□□ -2.15
SEH1P53011 SWF1YDR126W 1011 nt1.6□□□□□ -2.15
SEH1P53011 YBL071CYBL071C 309 nt1.6□□□□□ -2.15
SEH1P53011 RTP1YMR185W 2946 nt1.6□□□□□ -2.15
SEH1P53011 SEC63YOR254C 1992 nt1.59□□□□□ -2.15
SEH1P53011 NUP192YJL039C 5052 nt1.59□□□□□ -2.15
SEH1P53011 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt1.59□□□□□ -2.15
SEH1P53011 YBR285WYBR285W 435 nt1.59□□□□□ -2.15
SEH1P53011 SFB2YNL049C 2631 nt1.59□□□□□ -2.16
SEH1P53011 PKH3YDR466W 2697 nt1.59□□□□□ -2.16
SEH1P53011 HSL1YKL101W 4557 nt1.59□□□□□ -2.16
SEH1P53011 IRA1YBR140C 9279 nt1.58□□□□□ -2.16
SEH1P53011 YER079WYER079W 633 nt1.58□□□□□ -2.16
SEH1P53011 YOR053WYOR053W 342 nt1.58□□□□□ -2.16
SEH1P53011 TRM3YDL112W 4311 nt1.57□□□□□ -2.16
SEH1P53011 TBS1YBR150C 3285 nt1.57□□□□□ -2.16
SEH1P53011 SEF1YBL066C 3447 nt1.57□□□□□ -2.16
SEH1P53011 CFT1YDR301W 4074 nt1.57□□□□□ -2.16
SEH1P53011 TDA9YML081W 3756 nt1.57□□□□□ -2.16
SEH1P53011 RPL42BYHR141C 321 nt1.57□□□□□ -2.16
SEH1P53011 RPS24BYIL069C 408 nt1.57□□□□□ -2.16
SEH1P53011 YML009C-AYML009C-A 327 nt1.57□□□□□ -2.16
SEH1P53011 RPL42AYNL162W 321 nt1.57□□□□□ -2.16
SEH1P53011 SAR1YPL218W 573 nt1.57□□□□□ -2.16
SEH1P53011 YPR099CYPR099C 357 nt1.57□□□□□ -2.16
SEH1P53011 YPR170W-AYPR170W-A 186 nt1.57□□□□□ -2.16
SEH1P53011 MSH6YDR097C 3729 nt1.56□□□□□ -2.16
SEH1P53011 RTT102YGR275W 474 nt1.56□□□□□ -2.16
SEH1P53011 ZRG8YER033C 3231 nt1.56□□□□□ -2.16
SEH1P53011 SEY1YOR165W 2331 nt1.56□□□□□ -2.16
SEH1P53011 DAS1YJL149W 1992 nt1.56□□□□□ -2.16
SEH1P53011 PAN3YKL025C 2040 nt1.56□□□□□ -2.16
SEH1P53011 TFC8YPL007C 1767 nt1.55□□□□□ -2.16
SEH1P53011 RKM1YPL208W 1752 nt1.55□□□□□ -2.16
SEH1P53011 MEC1YBR136W 7107 nt1.55□□□□□ -2.16
SEH1P53011 RPS27AYKL156W 249 nt1.55□□□□□ -2.16
SEH1P53011 YAR047CYAR047C 321 nt1.55□□□□□ -2.16
SEH1P53011 GNT1YOR320C 1476 nt1.55□□□□□ -2.16
SEH1P53011 PIK1YNL267W 3201 nt1.55□□□□□ -2.16
SEH1P53011 TOF2YKR010C 2316 nt1.54□□□□□ -2.16
SEH1P53011 YCR043CYCR043C 384 nt1.54□□□□□ -2.16
SEH1P53011 PAU3YCR104W 375 nt1.54□□□□□ -2.16
SEH1P53011 YGL239CYGL239C 315 nt1.54□□□□□ -2.16
SEH1P53011 YHR138CYHR138C 345 nt1.54□□□□□ -2.16
SEH1P53011 YKL183C-AYKL183C-A 213 nt1.54□□□□□ -2.16
SEH1P53011 UBC7YMR022W 498 nt1.54□□□□□ -2.16
SEH1P53011 MRPL50YNR022C 420 nt1.54□□□□□ -2.16
SEH1P53011 YOR293C-AYOR293C-A 150 nt1.54□□□□□ -2.16
SEH1P53011 YPL182CYPL182C 384 nt1.54□□□□□ -2.16
SEH1P53011 VPS15YBR097W 4365 nt1.54□□□□□ -2.16
SEH1P53011 HMRA1YCR097W 381 nt1.53□□□□□ -2.16
SEH1P53011 YDL152WYDL152W 366 nt1.53□□□□□ -2.16
SEH1P53011 YLR434CYLR434C 384 nt1.53□□□□□ -2.16
SEH1P53011 YPL185WYPL185W 396 nt1.53□□□□□ -2.16
SEH1P53011 IRE1YHR079C 3348 nt1.53□□□□□ -2.17
SEH1P53011 SAC3YDR159W 3906 nt1.52□□□□□ -2.17
SEH1P53011 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt1.52□□□□□ -2.17
SEH1P53011 YAL068W-AYAL068W-A 255 nt1.52□□□□□ -2.17
SEH1P53011 HIR3YJR140C 4947 nt1.51□□□□□ -2.17
SEH1P53011 RPL31AYDL075W 342 nt1.51□□□□□ -2.17
SEH1P53011 YER088C-AYER088C-A 324 nt1.51□□□□□ -2.17
SEH1P53011 YLR334CYLR334C 381 nt1.51□□□□□ -2.17
SEH1P53011 CGI121YML036W 546 nt1.51□□□□□ -2.17
SEH1P53011 COA6YMR244C-A 315 nt1.51□□□□□ -2.17
SEH1P53011 YOR146WYOR146W 306 nt1.51□□□□□ -2.17
SEH1P53011 YBR174CYBR174C 315 nt1.51□□□□□ -2.17
SEH1P53011 PCF11YDR228C 1881 nt1.5□□□□□ -2.17
SEH1P53011 NOP53YPL146C 1368 nt1.5□□□□□ -2.17
SEH1P53011 YDR118W-AYDR118W-A 117 nt1.5□□□□□ -2.17
SEH1P53011 TIM13YGR181W 318 nt1.5□□□□□ -2.17
SEH1P53011 YHL037CYHL037C 402 nt1.5□□□□□ -2.17
SEH1P53011 PHS1YJL097W 654 nt1.5□□□□□ -2.17
SEH1P53011 TRX1YLR043C 312 nt1.5□□□□□ -2.17
SEH1P53011 BSC3YLR465C 309 nt1.5□□□□□ -2.17
SEH1P53011 RPL9BYNL067W 576 nt1.5□□□□□ -2.17
SEH1P53011 CHS1YNL192W 3396 nt1.5□□□□□ -2.17
SEH1P53011 MDM20YOL076W 2391 nt1.49□□□□□ -2.17
SEH1P53011 YGR250CYGR250C 2346 nt1.49□□□□□ -2.17
SEH1P53011 snR56snR56 88 nt1.49□□□□□ -2.17
SEH1P53011 YDL011CYDL011C 324 nt1.49□□□□□ -2.17
SEH1P53011 YKL083WYKL083W 615 nt1.49□□□□□ -2.17
SEH1P53011 YPR012WYPR012W 255 nt1.49□□□□□ -2.17
SEH1P53011 BRR2YER172C 6492 nt1.49□□□□□ -2.17
SEH1P53011 SSK2YNR031C 4740 nt1.49□□□□□ -2.17
SEH1P53011 SWI5YDR146C 2130 nt1.48□□□□□ -2.17
SEH1P53011 ADR1YDR216W 3972 nt1.48□□□□□ -2.17
SEH1P53011 WIP1YDR374W-A 270 nt1.48□□□□□ -2.17
SEH1P53011 YMR230W-AYMR230W-A 189 nt1.48□□□□□ -2.17
SEH1P53011 FMP23YBR047W 528 nt1.48□□□□□ -2.17
SEH1P53011 YLR422WYLR422W 5799 nt1.48□□□□□ -2.17
SEH1P53011 DCP2YNL118C 2913 nt1.48□□□□□ -2.17
SEH1P53011 FRK1YPL141C 2598 nt1.48□□□□□ -2.17
SEH1P53011 YER137W-AYER137W-A 306 nt1.47□□□□□ -2.17
SEH1P53011 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt1.47□□□□□ -2.17
SEH1P53011 HCH1YNL281W 462 nt1.47□□□□□ -2.17
SEH1P53011 YPL261CYPL261C 309 nt1.47□□□□□ -2.17
SEH1P53011 MSC6YOR354C 2079 nt1.47□□□□□ -2.17
SEH1P53011 KCS1YDR017C 3153 nt1.47□□□□□ -2.17
SEH1P53011 SBE22YHR103W 2559 nt1.47□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 106.3 ms