Protein–RNA interactions for Protein: P49760

CLK2, Dual specificity protein kinase CLK2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK2P49760 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLK2P49760 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLK2P49760 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLK2P49760 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLK2P49760 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLK2P49760 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLK2P49760 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLK2P49760 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLK2P49760 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLK2P49760 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CLK2P49760 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLK2P49760 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLK2P49760 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLK2P49760 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLK2P49760 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLK2P49760 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLK2P49760 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLK2P49760 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLK2P49760 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLK2P49760 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLK2P49760 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLK2P49760 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLK2P49760 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLK2P49760 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLK2P49760 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CLK2P49760 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLK2P49760 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLK2P49760 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLK2P49760 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLK2P49760 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLK2P49760 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLK2P49760 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLK2P49760 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLK2P49760 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLK2P49760 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLK2P49760 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLK2P49760 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLK2P49760 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLK2P49760 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLK2P49760 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLK2P49760 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CLK2P49760 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLK2P49760 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CLK2P49760 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CLK2P49760 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLK2P49760 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CLK2P49760 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLK2P49760 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLK2P49760 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLK2P49760 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLK2P49760 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLK2P49760 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CLK2P49760 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLK2P49760 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLK2P49760 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CLK2P49760 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CLK2P49760 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CLK2P49760 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLK2P49760 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLK2P49760 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLK2P49760 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLK2P49760 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLK2P49760 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLK2P49760 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLK2P49760 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLK2P49760 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLK2P49760 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLK2P49760 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLK2P49760 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLK2P49760 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLK2P49760 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLK2P49760 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLK2P49760 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLK2P49760 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLK2P49760 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLK2P49760 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLK2P49760 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLK2P49760 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLK2P49760 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLK2P49760 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLK2P49760 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLK2P49760 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CLK2P49760 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLK2P49760 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLK2P49760 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLK2P49760 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CLK2P49760 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLK2P49760 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLK2P49760 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLK2P49760 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLK2P49760 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLK2P49760 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLK2P49760 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLK2P49760 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLK2P49760 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CLK2P49760 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLK2P49760 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLK2P49760 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLK2P49760 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLK2P49760 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms