Protein–RNA interactions for Protein: P49427

CDC34, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC34P49427 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC34P49427 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC34P49427 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC34P49427 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC34P49427 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC34P49427 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC34P49427 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC34P49427 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC34P49427 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC34P49427 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC34P49427 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC34P49427 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC34P49427 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC34P49427 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC34P49427 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC34P49427 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC34P49427 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC34P49427 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC34P49427 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC34P49427 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC34P49427 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC34P49427 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC34P49427 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC34P49427 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC34P49427 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC34P49427 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC34P49427 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC34P49427 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC34P49427 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC34P49427 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC34P49427 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC34P49427 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC34P49427 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC34P49427 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC34P49427 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC34P49427 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC34P49427 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC34P49427 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC34P49427 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC34P49427 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC34P49427 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC34P49427 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC34P49427 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC34P49427 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC34P49427 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC34P49427 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC34P49427 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC34P49427 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC34P49427 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC34P49427 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC34P49427 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC34P49427 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC34P49427 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC34P49427 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC34P49427 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC34P49427 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC34P49427 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC34P49427 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC34P49427 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC34P49427 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC34P49427 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC34P49427 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC34P49427 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC34P49427 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC34P49427 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC34P49427 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC34P49427 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC34P49427 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC34P49427 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC34P49427 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC34P49427 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC34P49427 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC34P49427 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC34P49427 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC34P49427 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC34P49427 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC34P49427 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC34P49427 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC34P49427 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC34P49427 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC34P49427 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC34P49427 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC34P49427 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC34P49427 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC34P49427 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC34P49427 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC34P49427 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC34P49427 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC34P49427 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC34P49427 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC34P49427 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC34P49427 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC34P49427 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC34P49427 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC34P49427 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC34P49427 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC34P49427 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC34P49427 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC34P49427 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC34P49427 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms