Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMPOP42166 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMPOP42166 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMPOP42166 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TMPOP42166 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMPOP42166 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMPOP42166 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMPOP42166 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMPOP42166 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMPOP42166 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMPOP42166 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMPOP42166 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMPOP42166 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMPOP42166 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMPOP42166 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMPOP42166 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMPOP42166 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMPOP42166 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMPOP42166 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMPOP42166 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMPOP42166 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMPOP42166 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMPOP42166 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TMPOP42166 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMPOP42166 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMPOP42166 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMPOP42166 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TMPOP42166 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMPOP42166 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMPOP42166 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMPOP42166 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMPOP42166 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMPOP42166 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMPOP42166 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMPOP42166 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMPOP42166 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMPOP42166 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMPOP42166 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMPOP42166 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMPOP42166 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMPOP42166 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMPOP42166 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMPOP42166 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMPOP42166 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMPOP42166 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMPOP42166 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMPOP42166 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMPOP42166 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMPOP42166 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMPOP42166 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMPOP42166 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMPOP42166 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TMPOP42166 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMPOP42166 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMPOP42166 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMPOP42166 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMPOP42166 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMPOP42166 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMPOP42166 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMPOP42166 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMPOP42166 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMPOP42166 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMPOP42166 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMPOP42166 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMPOP42166 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMPOP42166 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMPOP42166 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMPOP42166 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMPOP42166 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMPOP42166 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMPOP42166 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMPOP42166 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMPOP42166 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMPOP42166 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMPOP42166 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TMPOP42166 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TMPOP42166 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMPOP42166 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMPOP42166 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMPOP42166 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMPOP42166 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMPOP42166 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMPOP42166 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMPOP42166 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TMPOP42166 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TMPOP42166 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TMPOP42166 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
TMPOP42166 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TMPOP42166 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMPOP42166 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMPOP42166 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TMPOP42166 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TMPOP42166 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMPOP42166 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TMPOP42166 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMPOP42166 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TMPOP42166 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMPOP42166 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TMPOP42166 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMPOP42166 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms