Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TNFSF9P41273 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNFSF9P41273 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms