Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
POLR2IP36954 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR2IP36954 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms