Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP6V1E1P36543 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP6V1E1P36543 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP6V1E1P36543 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP6V1E1P36543 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP6V1E1P36543 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP6V1E1P36543 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP6V1E1P36543 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP6V1E1P36543 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP6V1E1P36543 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP6V1E1P36543 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP6V1E1P36543 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP6V1E1P36543 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP6V1E1P36543 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP6V1E1P36543 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP6V1E1P36543 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP6V1E1P36543 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP6V1E1P36543 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP6V1E1P36543 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP6V1E1P36543 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP6V1E1P36543 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP6V1E1P36543 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP6V1E1P36543 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP6V1E1P36543 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP6V1E1P36543 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP6V1E1P36543 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP6V1E1P36543 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP6V1E1P36543 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP6V1E1P36543 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP6V1E1P36543 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP6V1E1P36543 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP6V1E1P36543 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP6V1E1P36543 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP6V1E1P36543 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP6V1E1P36543 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP6V1E1P36543 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP6V1E1P36543 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP6V1E1P36543 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP6V1E1P36543 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP6V1E1P36543 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP6V1E1P36543 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP6V1E1P36543 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP6V1E1P36543 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP6V1E1P36543 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP6V1E1P36543 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP6V1E1P36543 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP6V1E1P36543 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP6V1E1P36543 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP6V1E1P36543 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP6V1E1P36543 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP6V1E1P36543 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP6V1E1P36543 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP6V1E1P36543 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP6V1E1P36543 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP6V1E1P36543 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP6V1E1P36543 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP6V1E1P36543 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP6V1E1P36543 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP6V1E1P36543 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP6V1E1P36543 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP6V1E1P36543 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP6V1E1P36543 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP6V1E1P36543 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP6V1E1P36543 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP6V1E1P36543 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP6V1E1P36543 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP6V1E1P36543 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP6V1E1P36543 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP6V1E1P36543 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP6V1E1P36543 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP6V1E1P36543 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP6V1E1P36543 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATP6V1E1P36543 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATP6V1E1P36543 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATP6V1E1P36543 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATP6V1E1P36543 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATP6V1E1P36543 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATP6V1E1P36543 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATP6V1E1P36543 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP6V1E1P36543 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms