Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXD10P28358 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXD10P28358 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXD10P28358 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXD10P28358 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXD10P28358 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXD10P28358 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXD10P28358 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXD10P28358 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXD10P28358 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXD10P28358 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXD10P28358 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXD10P28358 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXD10P28358 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXD10P28358 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXD10P28358 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXD10P28358 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXD10P28358 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXD10P28358 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXD10P28358 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXD10P28358 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXD10P28358 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXD10P28358 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXD10P28358 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXD10P28358 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXD10P28358 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXD10P28358 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXD10P28358 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXD10P28358 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXD10P28358 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXD10P28358 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXD10P28358 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXD10P28358 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXD10P28358 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXD10P28358 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXD10P28358 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXD10P28358 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXD10P28358 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXD10P28358 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXD10P28358 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXD10P28358 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXD10P28358 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXD10P28358 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXD10P28358 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXD10P28358 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXD10P28358 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXD10P28358 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXD10P28358 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXD10P28358 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXD10P28358 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXD10P28358 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXD10P28358 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXD10P28358 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXD10P28358 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXD10P28358 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXD10P28358 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HOXD10P28358 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXD10P28358 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXD10P28358 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXD10P28358 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXD10P28358 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXD10P28358 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXD10P28358 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXD10P28358 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXD10P28358 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXD10P28358 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXD10P28358 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXD10P28358 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXD10P28358 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXD10P28358 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXD10P28358 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXD10P28358 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXD10P28358 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXD10P28358 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXD10P28358 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXD10P28358 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXD10P28358 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXD10P28358 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXD10P28358 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXD10P28358 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXD10P28358 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXD10P28358 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXD10P28358 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXD10P28358 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXD10P28358 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXD10P28358 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXD10P28358 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXD10P28358 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXD10P28358 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXD10P28358 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXD10P28358 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXD10P28358 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXD10P28358 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXD10P28358 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXD10P28358 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXD10P28358 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXD10P28358 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXD10P28358 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXD10P28358 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXD10P28358 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms