Protein–RNA interactions for Protein: P28004

PRP45, Pre-mRNA-processing protein 45, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRP45P28004 BPH1YCR032W 6504 nt2.38□□□□□ -2.03
PRP45P28004 ISW1YBR245C 3390 nt2.38□□□□□ -2.03
PRP45P28004 TOP2YNL088W 4287 nt2.37□□□□□ -2.03
PRP45P28004 YBP1YBR216C 2025 nt2.37□□□□□ -2.03
PRP45P28004 TRS130YMR218C 3309 nt2.37□□□□□ -2.03
PRP45P28004 FAR11YNL127W 2862 nt2.37□□□□□ -2.03
PRP45P28004 YER079C-AYER079C-A 339 nt2.37□□□□□ -2.03
PRP45P28004 MAM33YIL070C 801 nt2.37□□□□□ -2.03
PRP45P28004 PAC1YOR269W 1485 nt2.37□□□□□ -2.03
PRP45P28004 PAN3YKL025C 2040 nt2.37□□□□□ -2.03
PRP45P28004 RIC1YLR039C 3171 nt2.36□□□□□ -2.03
PRP45P28004 YGL069CYGL069C 465 nt2.36□□□□□ -2.03
PRP45P28004 RPL32YBL092W 393 nt2.36□□□□□ -2.03
PRP45P28004 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt2.36□□□□□ -2.03
PRP45P28004 SMY1YKL079W 1971 nt2.36□□□□□ -2.03
PRP45P28004 TUS1YLR425W 3924 nt2.36□□□□□ -2.03
PRP45P28004 NUP192YJL039C 5052 nt2.35□□□□□ -2.03
PRP45P28004 DCP2YNL118C 2913 nt2.35□□□□□ -2.03
PRP45P28004 CDC53YDL132W 2448 nt2.35□□□□□ -2.03
PRP45P28004 STF2YGR008C 255 nt2.35□□□□□ -2.03
PRP45P28004 YHL041WYHL041W 450 nt2.35□□□□□ -2.03
PRP45P28004 SPO22YIL073C 2928 nt2.35□□□□□ -2.03
PRP45P28004 CRM1YGR218W 3255 nt2.34□□□□□ -2.03
PRP45P28004 YCR022CYCR022C 345 nt2.34□□□□□ -2.03
PRP45P28004 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt2.34□□□□□ -2.03
PRP45P28004 YBL012CYBL012C 402 nt2.34□□□□□ -2.03
PRP45P28004 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt2.34□□□□□ -2.03
PRP45P28004 YBR184WYBR184W 1572 nt2.34□□□□□ -2.03
PRP45P28004 MNL2YLR057W 2550 nt2.34□□□□□ -2.04
PRP45P28004 PEP3YLR148W 2757 nt2.33□□□□□ -2.04
PRP45P28004 CDC27YBL084C 2277 nt2.33□□□□□ -2.04
PRP45P28004 TOF2YKR010C 2316 nt2.33□□□□□ -2.04
PRP45P28004 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt2.33□□□□□ -2.04
PRP45P28004 SGO1YOR073W 1773 nt2.33□□□□□ -2.04
PRP45P28004 CSN9YDR179C 489 nt2.32□□□□□ -2.04
PRP45P28004 HYP2YEL034W 474 nt2.32□□□□□ -2.04
PRP45P28004 RPL42BYHR141C 321 nt2.32□□□□□ -2.04
PRP45P28004 YMR194C-AYMR194C-A 225 nt2.32□□□□□ -2.04
PRP45P28004 RPL42AYNL162W 321 nt2.32□□□□□ -2.04
PRP45P28004 YKU80YMR106C 1890 nt2.32□□□□□ -2.04
PRP45P28004 SBE22YHR103W 2559 nt2.32□□□□□ -2.04
PRP45P28004 HER1YOR227W 3741 nt2.31□□□□□ -2.04
PRP45P28004 YBL083CYBL083C 426 nt2.31□□□□□ -2.04
PRP45P28004 DAD3YBR233W-A 285 nt2.31□□□□□ -2.04
PRP45P28004 VMA9YCL005W-A 222 nt2.31□□□□□ -2.04
PRP45P28004 YDR239CYDR239C 2364 nt2.31□□□□□ -2.04
PRP45P28004 SEF1YBL066C 3447 nt2.31□□□□□ -2.04
PRP45P28004 RKM1YPL208W 1752 nt2.31□□□□□ -2.04
PRP45P28004 DFG16YOR030W 1860 nt2.31□□□□□ -2.04
PRP45P28004 PAU8YAL068C 363 nt2.3□□□□□ -2.04
PRP45P28004 PAU20YOL161C 363 nt2.3□□□□□ -2.04
PRP45P28004 YLR149CYLR149C 2193 nt2.3□□□□□ -2.04
PRP45P28004 STB4YMR019W 2850 nt2.29□□□□□ -2.04
PRP45P28004 RPL35AYDL191W 363 nt2.29□□□□□ -2.04
PRP45P28004 RPA34YJL148W 702 nt2.29□□□□□ -2.04
PRP45P28004 YLR154W-AYLR154W-A 186 nt2.29□□□□□ -2.04
PRP45P28004 SAR1YPL218W 573 nt2.29□□□□□ -2.04
PRP45P28004 MET18YIL128W 3099 nt2.29□□□□□ -2.04
PRP45P28004 SCH9YHR205W 2475 nt2.29□□□□□ -2.04
PRP45P28004 USO1YDL058W 5373 nt2.28□□□□□ -2.04
PRP45P28004 SIR3YLR442C 2937 nt2.28□□□□□ -2.04
PRP45P28004 VPH1YOR270C 2523 nt2.28□□□□□ -2.04
PRP45P28004 SEY1YOR165W 2331 nt2.28□□□□□ -2.04
PRP45P28004 YOR093CYOR093C 4947 nt2.28□□□□□ -2.04
PRP45P28004 SGM1YJR134C 2124 nt2.28□□□□□ -2.04
PRP45P28004 COA6YMR244C-A 315 nt2.28□□□□□ -2.04
PRP45P28004 YOR282WYOR282W 321 nt2.28□□□□□ -2.04
PRP45P28004 STE5YDR103W 2754 nt2.28□□□□□ -2.04
PRP45P28004 ORC2YBR060C 1863 nt2.28□□□□□ -2.04
PRP45P28004 snR65snR65 100 nt2.27□□□□□ -2.05
PRP45P28004 HOP2YGL033W 657 nt2.27□□□□□ -2.05
PRP45P28004 YOR333CYOR333C 417 nt2.27□□□□□ -2.05
PRP45P28004 GRR1YJR090C 3456 nt2.26□□□□□ -2.05
PRP45P28004 YDR286CYDR286C 345 nt2.26□□□□□ -2.05
PRP45P28004 RPS17AYML024W 411 nt2.26□□□□□ -2.05
PRP45P28004 ACM1YPL267W 630 nt2.26□□□□□ -2.05
PRP45P28004 HDA3YPR179C 1968 nt2.25□□□□□ -2.05
PRP45P28004 YDR048CYDR048C 315 nt2.25□□□□□ -2.05
PRP45P28004 TIM9YEL020W-A 264 nt2.25□□□□□ -2.05
PRP45P28004 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt2.25□□□□□ -2.05
PRP45P28004 YIL059CYIL059C 366 nt2.25□□□□□ -2.05
PRP45P28004 RPL39YJL189W 156 nt2.25□□□□□ -2.05
PRP45P28004 YAR029WYAR029W 225 nt2.25□□□□□ -2.05
PRP45P28004 YPR010C-AYPR010C-A 219 nt2.25□□□□□ -2.05
PRP45P28004 SLM1YIL105C 2061 nt2.25□□□□□ -2.05
PRP45P28004 VPS34YLR240W 2628 nt2.25□□□□□ -2.05
PRP45P28004 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt2.24□□□□□ -2.05
PRP45P28004 FMP23YBR047W 528 nt2.24□□□□□ -2.05
PRP45P28004 YLR422WYLR422W 5799 nt2.24□□□□□ -2.05
PRP45P28004 PET309YLR067C 2898 nt2.24□□□□□ -2.05
PRP45P28004 VPS8YAL002W 3825 nt2.23□□□□□ -2.05
PRP45P28004 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt2.22□□□□□ -2.05
PRP45P28004 HTB2YBL002W 396 nt2.22□□□□□ -2.05
PRP45P28004 IRR1YIL026C 3453 nt2.22□□□□□ -2.05
PRP45P28004 EFR3YMR212C 2349 nt2.22□□□□□ -2.05
PRP45P28004 CFT1YDR301W 4074 nt2.22□□□□□ -2.05
PRP45P28004 MNE1YOR350C 1992 nt2.21□□□□□ -2.05
PRP45P28004 YGL149WYGL149W 306 nt2.21□□□□□ -2.06
PRP45P28004 NOP53YPL146C 1368 nt2.21□□□□□ -2.06
PRP45P28004 FKS1YLR342W 5631 nt2.21□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 45.8 ms