Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TNFSF4P23510 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFSF4P23510 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms