Protein–RNA interactions for Protein: P20941

PDC, Phosducin, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCP20941 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDCP20941 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PDCP20941 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PDCP20941 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDCP20941 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDCP20941 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDCP20941 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDCP20941 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDCP20941 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDCP20941 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDCP20941 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDCP20941 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDCP20941 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDCP20941 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDCP20941 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDCP20941 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDCP20941 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDCP20941 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDCP20941 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDCP20941 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDCP20941 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDCP20941 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDCP20941 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDCP20941 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDCP20941 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDCP20941 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDCP20941 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDCP20941 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDCP20941 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDCP20941 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDCP20941 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDCP20941 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDCP20941 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDCP20941 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDCP20941 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDCP20941 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDCP20941 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDCP20941 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDCP20941 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDCP20941 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDCP20941 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDCP20941 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDCP20941 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDCP20941 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDCP20941 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDCP20941 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDCP20941 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDCP20941 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDCP20941 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PDCP20941 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PDCP20941 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDCP20941 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PDCP20941 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDCP20941 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDCP20941 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDCP20941 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDCP20941 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDCP20941 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDCP20941 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDCP20941 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDCP20941 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDCP20941 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDCP20941 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PDCP20941 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PDCP20941 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDCP20941 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDCP20941 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDCP20941 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDCP20941 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDCP20941 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDCP20941 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDCP20941 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDCP20941 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDCP20941 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDCP20941 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDCP20941 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDCP20941 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDCP20941 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDCP20941 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDCP20941 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDCP20941 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDCP20941 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDCP20941 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDCP20941 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDCP20941 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDCP20941 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDCP20941 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDCP20941 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDCP20941 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDCP20941 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PDCP20941 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDCP20941 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDCP20941 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDCP20941 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDCP20941 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDCP20941 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDCP20941 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDCP20941 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDCP20941 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDCP20941 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms