Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DESP17661 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DESP17661 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DESP17661 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DESP17661 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DESP17661 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DESP17661 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DESP17661 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DESP17661 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DESP17661 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DESP17661 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DESP17661 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DESP17661 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DESP17661 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DESP17661 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DESP17661 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DESP17661 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DESP17661 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DESP17661 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DESP17661 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DESP17661 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DESP17661 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DESP17661 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DESP17661 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
DESP17661 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DESP17661 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DESP17661 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DESP17661 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.29■■□□□ 1
DESP17661 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.29■■□□□ 1
DESP17661 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DESP17661 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
DESP17661 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DESP17661 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.29■■□□□ 1
DESP17661 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DESP17661 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.29■■□□□ 1
DESP17661 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DESP17661 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DESP17661 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.29■■□□□ 1
DESP17661 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DESP17661 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DESP17661 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DESP17661 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DESP17661 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.29■■□□□ 1
DESP17661 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.29■■□□□ 1
DESP17661 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
DESP17661 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.29■■□□□ 1
DESP17661 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DESP17661 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DESP17661 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DESP17661 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DESP17661 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DESP17661 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DESP17661 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DESP17661 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DESP17661 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DESP17661 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DESP17661 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DESP17661 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
DESP17661 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DESP17661 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.28■■□□□ 1
DESP17661 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
DESP17661 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DESP17661 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.28■■□□□ 1
DESP17661 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DESP17661 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DESP17661 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DESP17661 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DESP17661 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DESP17661 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DESP17661 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DESP17661 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DESP17661 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DESP17661 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
DESP17661 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DESP17661 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DESP17661 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DESP17661 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DESP17661 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
DESP17661 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DESP17661 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
DESP17661 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.27■■□□□ 1
DESP17661 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DESP17661 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DESP17661 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DESP17661 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DESP17661 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
DESP17661 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
DESP17661 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
DESP17661 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
DESP17661 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
DESP17661 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DESP17661 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DESP17661 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DESP17661 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DESP17661 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DESP17661 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DESP17661 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DESP17661 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DESP17661 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DESP17661 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms