Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCL3L1P16619 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms