Protein–RNA interactions for Protein: P15529

CD46, Membrane cofactor protein, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD46P15529 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD46P15529 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD46P15529 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD46P15529 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD46P15529 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD46P15529 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD46P15529 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD46P15529 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD46P15529 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD46P15529 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD46P15529 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD46P15529 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD46P15529 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD46P15529 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD46P15529 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD46P15529 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD46P15529 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD46P15529 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD46P15529 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD46P15529 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD46P15529 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD46P15529 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD46P15529 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD46P15529 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD46P15529 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD46P15529 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD46P15529 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD46P15529 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CD46P15529 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD46P15529 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD46P15529 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD46P15529 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD46P15529 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD46P15529 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD46P15529 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD46P15529 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD46P15529 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD46P15529 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD46P15529 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD46P15529 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD46P15529 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD46P15529 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD46P15529 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD46P15529 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD46P15529 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD46P15529 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD46P15529 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD46P15529 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD46P15529 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD46P15529 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD46P15529 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD46P15529 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD46P15529 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD46P15529 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD46P15529 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD46P15529 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD46P15529 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD46P15529 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD46P15529 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD46P15529 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD46P15529 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD46P15529 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD46P15529 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CD46P15529 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD46P15529 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD46P15529 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD46P15529 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD46P15529 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD46P15529 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD46P15529 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD46P15529 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD46P15529 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD46P15529 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD46P15529 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD46P15529 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD46P15529 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD46P15529 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD46P15529 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD46P15529 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD46P15529 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD46P15529 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD46P15529 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD46P15529 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD46P15529 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD46P15529 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD46P15529 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD46P15529 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD46P15529 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD46P15529 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD46P15529 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD46P15529 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD46P15529 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CD46P15529 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CD46P15529 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD46P15529 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD46P15529 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD46P15529 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD46P15529 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD46P15529 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CD46P15529 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms