Protein–RNA interactions for Protein: P13747

HLA-E, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-EP13747 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HLA-EP13747 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HLA-EP13747 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HLA-EP13747 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HLA-EP13747 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLA-EP13747 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLA-EP13747 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLA-EP13747 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLA-EP13747 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLA-EP13747 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLA-EP13747 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLA-EP13747 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLA-EP13747 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLA-EP13747 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLA-EP13747 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLA-EP13747 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLA-EP13747 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLA-EP13747 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLA-EP13747 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLA-EP13747 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLA-EP13747 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLA-EP13747 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLA-EP13747 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLA-EP13747 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLA-EP13747 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLA-EP13747 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLA-EP13747 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLA-EP13747 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLA-EP13747 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLA-EP13747 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLA-EP13747 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLA-EP13747 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HLA-EP13747 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HLA-EP13747 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HLA-EP13747 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HLA-EP13747 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HLA-EP13747 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HLA-EP13747 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HLA-EP13747 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HLA-EP13747 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HLA-EP13747 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HLA-EP13747 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HLA-EP13747 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HLA-EP13747 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HLA-EP13747 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HLA-EP13747 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HLA-EP13747 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HLA-EP13747 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HLA-EP13747 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HLA-EP13747 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HLA-EP13747 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HLA-EP13747 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HLA-EP13747 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HLA-EP13747 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HLA-EP13747 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HLA-EP13747 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HLA-EP13747 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HLA-EP13747 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HLA-EP13747 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HLA-EP13747 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HLA-EP13747 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HLA-EP13747 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HLA-EP13747 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HLA-EP13747 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HLA-EP13747 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HLA-EP13747 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HLA-EP13747 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HLA-EP13747 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HLA-EP13747 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HLA-EP13747 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HLA-EP13747 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLA-EP13747 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLA-EP13747 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLA-EP13747 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLA-EP13747 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLA-EP13747 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLA-EP13747 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLA-EP13747 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLA-EP13747 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLA-EP13747 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLA-EP13747 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLA-EP13747 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLA-EP13747 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLA-EP13747 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLA-EP13747 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLA-EP13747 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLA-EP13747 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLA-EP13747 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLA-EP13747 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLA-EP13747 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HLA-EP13747 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLA-EP13747 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLA-EP13747 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLA-EP13747 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLA-EP13747 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLA-EP13747 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLA-EP13747 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLA-EP13747 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLA-EP13747 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HLA-EP13747 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms