Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms