Protein–RNA interactions for Protein: P11387

TOP1, DNA topoisomerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1P11387 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TOP1P11387 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TOP1P11387 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TOP1P11387 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TOP1P11387 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TOP1P11387 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TOP1P11387 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TOP1P11387 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TOP1P11387 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TOP1P11387 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TOP1P11387 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TOP1P11387 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TOP1P11387 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TOP1P11387 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TOP1P11387 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TOP1P11387 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TOP1P11387 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TOP1P11387 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TOP1P11387 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TOP1P11387 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TOP1P11387 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TOP1P11387 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TOP1P11387 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TOP1P11387 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TOP1P11387 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TOP1P11387 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TOP1P11387 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TOP1P11387 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TOP1P11387 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TOP1P11387 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TOP1P11387 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TOP1P11387 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TOP1P11387 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TOP1P11387 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TOP1P11387 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TOP1P11387 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TOP1P11387 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TOP1P11387 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TOP1P11387 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TOP1P11387 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TOP1P11387 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TOP1P11387 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TOP1P11387 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TOP1P11387 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TOP1P11387 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TOP1P11387 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TOP1P11387 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TOP1P11387 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TOP1P11387 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TOP1P11387 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TOP1P11387 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TOP1P11387 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TOP1P11387 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TOP1P11387 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TOP1P11387 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TOP1P11387 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TOP1P11387 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TOP1P11387 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TOP1P11387 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TOP1P11387 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TOP1P11387 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TOP1P11387 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TOP1P11387 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TOP1P11387 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TOP1P11387 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TOP1P11387 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TOP1P11387 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TOP1P11387 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TOP1P11387 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TOP1P11387 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TOP1P11387 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TOP1P11387 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TOP1P11387 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TOP1P11387 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TOP1P11387 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TOP1P11387 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TOP1P11387 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TOP1P11387 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TOP1P11387 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TOP1P11387 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TOP1P11387 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TOP1P11387 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TOP1P11387 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TOP1P11387 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TOP1P11387 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TOP1P11387 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TOP1P11387 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TOP1P11387 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TOP1P11387 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TOP1P11387 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TOP1P11387 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TOP1P11387 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TOP1P11387 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TOP1P11387 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TOP1P11387 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TOP1P11387 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TOP1P11387 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TOP1P11387 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TOP1P11387 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TOP1P11387 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms