Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRFP10586 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRFP10586 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRFP10586 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRFP10586 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRFP10586 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRFP10586 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRFP10586 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRFP10586 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRFP10586 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRFP10586 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRFP10586 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRFP10586 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRFP10586 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRFP10586 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRFP10586 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRFP10586 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRFP10586 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRFP10586 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRFP10586 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRFP10586 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRFP10586 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRFP10586 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRFP10586 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRFP10586 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRFP10586 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRFP10586 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRFP10586 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRFP10586 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRFP10586 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRFP10586 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRFP10586 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRFP10586 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRFP10586 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRFP10586 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRFP10586 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRFP10586 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRFP10586 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRFP10586 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRFP10586 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRFP10586 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRFP10586 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRFP10586 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRFP10586 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRFP10586 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPRFP10586 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPRFP10586 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPRFP10586 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPRFP10586 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPRFP10586 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPRFP10586 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPRFP10586 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRFP10586 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRFP10586 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRFP10586 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRFP10586 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRFP10586 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRFP10586 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRFP10586 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRFP10586 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRFP10586 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPRFP10586 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRFP10586 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRFP10586 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRFP10586 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRFP10586 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRFP10586 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRFP10586 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRFP10586 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRFP10586 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRFP10586 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRFP10586 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRFP10586 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRFP10586 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRFP10586 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRFP10586 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRFP10586 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRFP10586 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRFP10586 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRFP10586 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRFP10586 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRFP10586 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRFP10586 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRFP10586 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRFP10586 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRFP10586 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRFP10586 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRFP10586 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRFP10586 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRFP10586 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRFP10586 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRFP10586 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRFP10586 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRFP10586 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRFP10586 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRFP10586 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRFP10586 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRFP10586 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRFP10586 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRFP10586 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms