Protein–RNA interactions for Protein: P09874

PARP1, Poly [ADP-ribose] polymerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP1P09874 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PARP1P09874 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PARP1P09874 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PARP1P09874 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PARP1P09874 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PARP1P09874 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PARP1P09874 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PARP1P09874 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PARP1P09874 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PARP1P09874 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PARP1P09874 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PARP1P09874 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PARP1P09874 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PARP1P09874 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PARP1P09874 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PARP1P09874 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PARP1P09874 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PARP1P09874 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PARP1P09874 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PARP1P09874 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PARP1P09874 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PARP1P09874 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PARP1P09874 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PARP1P09874 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PARP1P09874 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PARP1P09874 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PARP1P09874 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PARP1P09874 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PARP1P09874 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PARP1P09874 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PARP1P09874 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PARP1P09874 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PARP1P09874 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PARP1P09874 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PARP1P09874 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PARP1P09874 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PARP1P09874 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PARP1P09874 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PARP1P09874 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PARP1P09874 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PARP1P09874 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PARP1P09874 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PARP1P09874 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PARP1P09874 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PARP1P09874 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PARP1P09874 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PARP1P09874 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PARP1P09874 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PARP1P09874 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PARP1P09874 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PARP1P09874 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PARP1P09874 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PARP1P09874 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PARP1P09874 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PARP1P09874 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PARP1P09874 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PARP1P09874 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PARP1P09874 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PARP1P09874 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PARP1P09874 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PARP1P09874 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PARP1P09874 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PARP1P09874 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PARP1P09874 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PARP1P09874 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PARP1P09874 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PARP1P09874 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PARP1P09874 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PARP1P09874 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PARP1P09874 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PARP1P09874 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PARP1P09874 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PARP1P09874 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PARP1P09874 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PARP1P09874 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PARP1P09874 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PARP1P09874 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PARP1P09874 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PARP1P09874 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PARP1P09874 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PARP1P09874 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PARP1P09874 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PARP1P09874 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PARP1P09874 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PARP1P09874 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PARP1P09874 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PARP1P09874 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PARP1P09874 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PARP1P09874 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PARP1P09874 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PARP1P09874 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PARP1P09874 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PARP1P09874 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PARP1P09874 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PARP1P09874 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PARP1P09874 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PARP1P09874 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PARP1P09874 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PARP1P09874 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PARP1P09874 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms