Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POP4O95707 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POP4O95707 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POP4O95707 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POP4O95707 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POP4O95707 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POP4O95707 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POP4O95707 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POP4O95707 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POP4O95707 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POP4O95707 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
POP4O95707 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
POP4O95707 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POP4O95707 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POP4O95707 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
POP4O95707 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POP4O95707 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POP4O95707 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POP4O95707 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POP4O95707 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POP4O95707 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POP4O95707 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POP4O95707 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POP4O95707 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POP4O95707 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POP4O95707 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POP4O95707 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POP4O95707 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POP4O95707 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POP4O95707 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POP4O95707 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POP4O95707 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POP4O95707 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POP4O95707 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POP4O95707 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POP4O95707 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POP4O95707 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
POP4O95707 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POP4O95707 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POP4O95707 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
POP4O95707 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POP4O95707 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POP4O95707 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POP4O95707 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
POP4O95707 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
POP4O95707 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POP4O95707 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
POP4O95707 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POP4O95707 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POP4O95707 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
POP4O95707 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POP4O95707 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POP4O95707 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
POP4O95707 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POP4O95707 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
POP4O95707 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POP4O95707 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POP4O95707 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POP4O95707 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POP4O95707 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POP4O95707 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POP4O95707 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POP4O95707 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POP4O95707 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POP4O95707 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POP4O95707 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POP4O95707 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POP4O95707 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POP4O95707 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POP4O95707 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
POP4O95707 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POP4O95707 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POP4O95707 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POP4O95707 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POP4O95707 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POP4O95707 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POP4O95707 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POP4O95707 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
POP4O95707 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
POP4O95707 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
POP4O95707 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
POP4O95707 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
POP4O95707 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
POP4O95707 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
POP4O95707 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
POP4O95707 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
POP4O95707 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
POP4O95707 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
POP4O95707 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
POP4O95707 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
POP4O95707 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
POP4O95707 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
POP4O95707 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
POP4O95707 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
POP4O95707 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
POP4O95707 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
POP4O95707 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
POP4O95707 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
POP4O95707 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
POP4O95707 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms