Protein–RNA interactions for Protein: O95503

CBX6, Chromobox protein homolog 6, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX6O95503 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CBX6O95503 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CBX6O95503 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CBX6O95503 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CBX6O95503 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CBX6O95503 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CBX6O95503 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CBX6O95503 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CBX6O95503 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CBX6O95503 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CBX6O95503 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CBX6O95503 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CBX6O95503 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CBX6O95503 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CBX6O95503 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CBX6O95503 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CBX6O95503 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CBX6O95503 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CBX6O95503 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CBX6O95503 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CBX6O95503 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CBX6O95503 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CBX6O95503 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CBX6O95503 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CBX6O95503 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CBX6O95503 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CBX6O95503 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CBX6O95503 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CBX6O95503 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CBX6O95503 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CBX6O95503 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CBX6O95503 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CBX6O95503 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CBX6O95503 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CBX6O95503 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CBX6O95503 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CBX6O95503 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CBX6O95503 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CBX6O95503 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CBX6O95503 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CBX6O95503 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CBX6O95503 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CBX6O95503 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CBX6O95503 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CBX6O95503 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CBX6O95503 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CBX6O95503 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CBX6O95503 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CBX6O95503 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CBX6O95503 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CBX6O95503 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CBX6O95503 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CBX6O95503 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CBX6O95503 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CBX6O95503 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CBX6O95503 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CBX6O95503 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CBX6O95503 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CBX6O95503 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CBX6O95503 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CBX6O95503 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CBX6O95503 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CBX6O95503 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CBX6O95503 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CBX6O95503 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CBX6O95503 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CBX6O95503 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CBX6O95503 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CBX6O95503 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CBX6O95503 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CBX6O95503 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CBX6O95503 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CBX6O95503 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CBX6O95503 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CBX6O95503 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CBX6O95503 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CBX6O95503 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CBX6O95503 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CBX6O95503 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CBX6O95503 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CBX6O95503 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CBX6O95503 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CBX6O95503 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CBX6O95503 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CBX6O95503 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CBX6O95503 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CBX6O95503 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CBX6O95503 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CBX6O95503 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CBX6O95503 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CBX6O95503 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CBX6O95503 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CBX6O95503 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CBX6O95503 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CBX6O95503 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CBX6O95503 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CBX6O95503 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CBX6O95503 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CBX6O95503 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CBX6O95503 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms