Protein–RNA interactions for Protein: O95425

SVIL, Supervillin, humanhuman

Predictions only

Length 2,214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVILO95425 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SVILO95425 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SVILO95425 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SVILO95425 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SVILO95425 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SVILO95425 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SVILO95425 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SVILO95425 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SVILO95425 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SVILO95425 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SVILO95425 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SVILO95425 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SVILO95425 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SVILO95425 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SVILO95425 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SVILO95425 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SVILO95425 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SVILO95425 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SVILO95425 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SVILO95425 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SVILO95425 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SVILO95425 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SVILO95425 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SVILO95425 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SVILO95425 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SVILO95425 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SVILO95425 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SVILO95425 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SVILO95425 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SVILO95425 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SVILO95425 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SVILO95425 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SVILO95425 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SVILO95425 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SVILO95425 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SVILO95425 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SVILO95425 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SVILO95425 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SVILO95425 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SVILO95425 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SVILO95425 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SVILO95425 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SVILO95425 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SVILO95425 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SVILO95425 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SVILO95425 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SVILO95425 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SVILO95425 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SVILO95425 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SVILO95425 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SVILO95425 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SVILO95425 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SVILO95425 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SVILO95425 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SVILO95425 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SVILO95425 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SVILO95425 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SVILO95425 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SVILO95425 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SVILO95425 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SVILO95425 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SVILO95425 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SVILO95425 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SVILO95425 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SVILO95425 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SVILO95425 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SVILO95425 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SVILO95425 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SVILO95425 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SVILO95425 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SVILO95425 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SVILO95425 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SVILO95425 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SVILO95425 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SVILO95425 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SVILO95425 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SVILO95425 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SVILO95425 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SVILO95425 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SVILO95425 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SVILO95425 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SVILO95425 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SVILO95425 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SVILO95425 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SVILO95425 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SVILO95425 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SVILO95425 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SVILO95425 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SVILO95425 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SVILO95425 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SVILO95425 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SVILO95425 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SVILO95425 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SVILO95425 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SVILO95425 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SVILO95425 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SVILO95425 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SVILO95425 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SVILO95425 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SVILO95425 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms