Protein–RNA interactions for Protein: O94874

UFL1, E3 UFM1-protein ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFL1O94874 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UFL1O94874 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UFL1O94874 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UFL1O94874 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UFL1O94874 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
UFL1O94874 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UFL1O94874 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UFL1O94874 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UFL1O94874 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UFL1O94874 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UFL1O94874 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
UFL1O94874 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UFL1O94874 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UFL1O94874 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UFL1O94874 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UFL1O94874 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UFL1O94874 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
UFL1O94874 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
UFL1O94874 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
UFL1O94874 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UFL1O94874 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UFL1O94874 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UFL1O94874 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UFL1O94874 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UFL1O94874 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UFL1O94874 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UFL1O94874 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UFL1O94874 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UFL1O94874 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
UFL1O94874 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UFL1O94874 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UFL1O94874 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UFL1O94874 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UFL1O94874 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UFL1O94874 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UFL1O94874 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
UFL1O94874 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UFL1O94874 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UFL1O94874 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UFL1O94874 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UFL1O94874 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UFL1O94874 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UFL1O94874 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UFL1O94874 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
UFL1O94874 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UFL1O94874 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UFL1O94874 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UFL1O94874 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UFL1O94874 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UFL1O94874 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UFL1O94874 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UFL1O94874 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UFL1O94874 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UFL1O94874 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UFL1O94874 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UFL1O94874 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UFL1O94874 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UFL1O94874 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UFL1O94874 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UFL1O94874 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UFL1O94874 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
UFL1O94874 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UFL1O94874 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UFL1O94874 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UFL1O94874 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UFL1O94874 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UFL1O94874 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UFL1O94874 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UFL1O94874 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UFL1O94874 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
UFL1O94874 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UFL1O94874 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UFL1O94874 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UFL1O94874 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UFL1O94874 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UFL1O94874 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UFL1O94874 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UFL1O94874 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UFL1O94874 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UFL1O94874 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UFL1O94874 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UFL1O94874 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UFL1O94874 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UFL1O94874 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UFL1O94874 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UFL1O94874 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UFL1O94874 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UFL1O94874 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UFL1O94874 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UFL1O94874 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UFL1O94874 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UFL1O94874 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UFL1O94874 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UFL1O94874 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UFL1O94874 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UFL1O94874 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UFL1O94874 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UFL1O94874 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UFL1O94874 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UFL1O94874 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms