Protein–RNA interactions for Protein: O75534

CSDE1, Cold shock domain-containing protein E1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSDE1O75534 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSDE1O75534 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSDE1O75534 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSDE1O75534 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSDE1O75534 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSDE1O75534 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSDE1O75534 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CSDE1O75534 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSDE1O75534 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSDE1O75534 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSDE1O75534 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSDE1O75534 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSDE1O75534 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CSDE1O75534 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSDE1O75534 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSDE1O75534 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSDE1O75534 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSDE1O75534 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSDE1O75534 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSDE1O75534 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSDE1O75534 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSDE1O75534 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSDE1O75534 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSDE1O75534 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSDE1O75534 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSDE1O75534 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSDE1O75534 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSDE1O75534 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSDE1O75534 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSDE1O75534 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSDE1O75534 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSDE1O75534 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSDE1O75534 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSDE1O75534 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CSDE1O75534 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CSDE1O75534 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSDE1O75534 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSDE1O75534 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSDE1O75534 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSDE1O75534 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSDE1O75534 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSDE1O75534 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSDE1O75534 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSDE1O75534 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSDE1O75534 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSDE1O75534 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSDE1O75534 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSDE1O75534 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSDE1O75534 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSDE1O75534 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSDE1O75534 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSDE1O75534 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSDE1O75534 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSDE1O75534 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSDE1O75534 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSDE1O75534 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CSDE1O75534 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSDE1O75534 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSDE1O75534 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSDE1O75534 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSDE1O75534 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSDE1O75534 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSDE1O75534 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSDE1O75534 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CSDE1O75534 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSDE1O75534 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSDE1O75534 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSDE1O75534 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSDE1O75534 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSDE1O75534 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSDE1O75534 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSDE1O75534 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSDE1O75534 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSDE1O75534 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CSDE1O75534 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSDE1O75534 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSDE1O75534 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSDE1O75534 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSDE1O75534 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSDE1O75534 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSDE1O75534 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSDE1O75534 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CSDE1O75534 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSDE1O75534 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSDE1O75534 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSDE1O75534 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CSDE1O75534 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CSDE1O75534 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CSDE1O75534 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CSDE1O75534 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CSDE1O75534 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSDE1O75534 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms