Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPFIA4O75335 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPFIA4O75335 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms